Construire dynamiquement la liste des liens vers la saisie des protoc…

…oles à partir de la table synthese.bib_sources - cf #69
PnX-SI · Nov 3, 2015 · 0bd75e8 · 0bd75e8
1 parent f98ea65
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diff --git a/apps/backend/modules/home/actions/actions.class.php b/apps/backend/modules/home/actions/actions.class.php
@@ -64,6 +64,35 @@ public function executeIndex(sfRequest $request)
 
         if($this->getUser()->isAuthenticated()){
             slot('title', sfGeonatureConfig::$appname_main);
+            // construction dynamique de la liste des liens vers les formulaires
+            $groupes = BibSourcesTable::listSourcesGroupes();
+            $sources = BibSourcesTable::listActiveSources();
+            $this->lien_saisie = '';
+            foreach ($groupes as $groupe)
+            {  
+                $group = $groupe['groupe'];
+                $this->liens_saisie .= '<b>'.$group.'</b><br/>';
+                foreach ($sources as $source)
+                {  
+                    $source_group = $source['groupe'];
+                    $url = $source['url'];
+                    $target = $source['target'];
+                    $picto = $source['picto'];
+                    $nom_source = $source['nom_source'];
+                    if($source_group == $group)
+                    {
+                        $this->lien_saisie = '';
+                        $this->lien_saisie .= '<div style="margin:10px 0 0 50px ">';
+                        $this->lien_saisie .= '<div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><a href="'.$url.'" target="'.$target.'" style="text-decoration: none"><img src="'.$picto.'" border="0"> '.$nom_source.'</a></div>';
+                        $this->lien_saisie .= '</div>';
+                        $this->liens_saisie .= $this->lien_saisie;
+
+                    }
+
+                }
+            }
+
+
         }
         else{
            # $this->redirect('@login');

diff --git a/apps/backend/modules/home/templates/indexSuccess.php b/apps/backend/modules/home/templates/indexSuccess.php
@@ -23,32 +23,7 @@
         <div id="contenu_saisie" style="margin-bottom:30px">
             Pour saisir de nouvelles données, vous pouvez utiliser l'un des liens ci-dessous.<br/>
             Pour modifier des données contact faune, contact invertébré ou mortalité, vous devez passer par la synthèse pour retrouver les enregistrements à modifier.<br/><br/>
-            FAUNE<br/>
-                <div style="margin:10px 0 0 50px ">
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><img src="images/pictos/amphibien.gif" border="0"></div>
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><a href="cf" style="text-decoration: none">Saisie contact faune</a></div>
-                </div>
-                <div style="margin:10px 0 0 50px ">
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><img src="images/pictos/insecte.gif" border="0"></div>
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><a href="invertebre" style="text-decoration: none">Saisie contact invertébré</a></div>
-                </div>
-                <div style="margin:10px 0 0 50px ">
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><img src="images/pictos/squelette.png" border="0"></div>
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><a href="mortalite" style="text-decoration: none">Saisie mortalité faune</a></div>
-                </div>
-            FLORE<br/>
-                <!--<div style="margin:10px 0 0 50px ">
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><img src="images/pictos/plante.gif" border="0"></div>
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><a href="fp" style="text-decoration: none">Saisie flore prioritaire</a></div>
-                </div>-->
-                <div style="margin:10px 0 0 50px ">
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><img src="images/pictos/plante.gif" border="0"></div>
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><a href="fs" style="text-decoration: none">Saisie flore station</a></div>
-                </div>
-                <div style="margin:10px 0 0 50px ">
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><img src="images/pictos/mousse.gif" border="0"></div>
-                    <div style="vertical-align:middle;display:inline-block;"><a href="bryo" style="text-decoration: none">Saisie bryophytes</a></div>
-                </div>
+            <? echo $liens_saisie;?>
         </div>
         <!--
         <div id="bande_consultation" style="color:#FFFFFF;background: linear-gradient(90deg, #f09819 30%, #edde5d 90%) repeat scroll 0 0 rgba(0, 0, 0, 0);letter-spacing:5px;font-weight:bold;text-shadow:0 0 3px #000;height:25px;">

diff --git a/config/doctrine/schema.yml b/config/doctrine/schema.yml
@@ -265,6 +265,11 @@ BibSources:
     db_schema: string(50)
     db_table: string(50)
     db_field: string(50)
+    url: string(255)
+    target: string(10)
+    picto: string(255)
+    groupe: string(50)
+    actif: boolean(1)
 BibSupports:
   tableName: meta.bib_supports
   columns:

diff --git a/data/2154/data_synthese_2154.sql b/data/2154/data_synthese_2154.sql
@@ -328,11 +328,12 @@ SET search_path = synthese, pg_catalog;
 -- Data for Name: bib_sources; Type: TABLE DATA; Schema: synthese; Owner: geonatuser
 --
 
-INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field) VALUES (1, 'Contact faune', 'contenu des tables t_fiche_cf et t_releves_cf de la base faune postgres', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'contactfaune', 't_releves_cf', 'id_releve_cf');
-INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field) VALUES (3, 'Contact invertébrés', 'contenu des tables t_fiches_inv et t_releves_inv de la base faune postgres', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'contactinv', 't_releves_inv', 'id_releve_inv');
-INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field) VALUES (4, 'Flore prioritaire', 'Relevés en présence-absence de la flore prioritaire', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'florepatri', 't_apresence', 'indexap');
-INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field) VALUES (5, 'Flore station', 'Données de relevés floristique stationnels complets ou partiel', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'florestation', 'cor_fs_taxon', 'gid');
-INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field) VALUES (6, 'Bryophytes', 'Données de contact bryologique', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'bryophytes', 'cor_bryo_taxon', 'gid');
+INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field, url, target, picto, groupe, actif) VALUES (1, 'Contact faune', 'contenu des tables t_fiche_cf et t_releves_cf de la base faune postgres', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'contactfaune', 't_releves_cf', 'id_releve_cf', 'cf', NULL, 'images/pictos/amphibien.gif', 'FAUNE', true);
+INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field, url, target, picto, groupe, actif) VALUES (2, 'Mortalité', 'contenu des tables t_fiche_cf et t_releves_cf de la base faune postgres', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'contactfaune', 't_releves_cf', 'id_releve_cf', 'mortalite', NULL, 'images/pictos/squelette.png', 'FAUNE', true);
+INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field, url, target, picto, groupe, actif) VALUES (3, 'Contact invertébrés', 'contenu des tables t_fiches_inv et t_releves_inv de la base faune postgres', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'contactinv', 't_releves_inv', 'id_releve_inv', 'invertebre', NULL, 'images/pictos/insecte.gif', 'FAUNE', true);
+INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field, url, target, picto, groupe, actif) VALUES (4, 'Flore prioritaire', 'Relevés en présence-absence de la flore prioritaire', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'florepatri', 't_apresence', 'indexap', 'pda', NULL, 'images/pictos/plante.gif', 'FLORE', false);
+INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field, url, target, picto, groupe, actif) VALUES (5, 'Flore station', 'Données de relevés floristique stationnels complets ou partiel', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'florestation', 'cor_fs_taxon', 'gid', 'fs', NULL, 'images/pictos/plante.gif', 'FLORE', true);
+INSERT INTO bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field, url, target, picto, groupe, actif) VALUES (6, 'Bryophytes', 'Données de contact bryologique', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'bryophytes', 'cor_bryo_taxon', 'gid', 'bryo', NULL, 'images/pictos/mousse.gif', 'FLORE', true);
 
 SET search_path = taxonomie, pg_catalog;
 

diff --git a/data/2154/synthese_2154.sql b/data/2154/synthese_2154.sql
@@ -313,22 +313,27 @@ $$;
 
 CREATE OR REPLACE FUNCTION contactfaune.synthese_insert_releve_cf()
   RETURNS trigger AS
-$$
+$BODY$
 DECLARE
 	fiche RECORD;
-	test integer;
 	mesobservateurs character varying(255);
 	criteresynthese integer;
-	unite integer;
 	idsource integer;
+	idsourcem integer;
+	idsourcecf integer;
+	unite integer;
 BEGIN
-
 	--Récupération des données id_source dans la table synthese.bib_sources
-	SELECT INTO idsource id_source FROM synthese.bib_sources  WHERE db_schema='contactfaune' AND db_field = 'id_releve_cf';
-
+	SELECT INTO idsourcem id_source FROM synthese.bib_sources  WHERE db_schema='contactfaune' AND db_field = 'id_releve_cf' AND nom_source = 'Mortalité';
+	SELECT INTO idsourcecf id_source FROM synthese.bib_sources  WHERE db_schema='contactfaune' AND db_field = 'id_releve_cf' AND nom_source = 'Contact faune';
 	--Récupération des données dans la table t_fiches_cf et de la liste des observateurs
 	SELECT INTO fiche * FROM contactfaune.t_fiches_cf WHERE id_cf = new.id_cf;
 	SELECT INTO criteresynthese id_critere_synthese FROM contactfaune.bib_criteres_cf WHERE id_critere_cf = new.id_critere_cf;
+	-- Récupération du id_source selon le critère d'observation, Si critère = 2 alors on est dans une source mortalité (=2) sinon cf (=1)
+	IF criteresynthese = 2 THEN idsource = idsourcem;
+	ELSE
+	    idsource = idsourcecf;
+	END IF;
 	SELECT INTO mesobservateurs o.observateurs FROM contactfaune.t_releves_cf r
 	JOIN contactfaune.t_fiches_cf f ON f.id_cf = r.id_cf
 	LEFT JOIN (
@@ -338,7 +343,7 @@ BEGIN
                 GROUP BY id_cf
             ) o ON o.id_cf = f.id_cf
 	WHERE r.id_releve_cf = new.id_releve_cf;
-
+	
 	INSERT INTO synthese.syntheseff (
 		id_source,
 		id_fiche_source,
@@ -387,7 +392,7 @@ BEGIN
 	);
 	RETURN NEW; 			
 END;
-$$
+$BODY$
   LANGUAGE plpgsql VOLATILE
   COST 100;
 ALTER FUNCTION contactfaune.synthese_insert_releve_cf()
@@ -4444,7 +4449,12 @@ CREATE TABLE bib_sources (
     db_name character varying(50),
     db_schema character varying(50),
     db_table character varying(50),
-    db_field character varying(50)
+    db_field character varying(50),
+    url character varying(255),
+    target character varying(10),
+    picto character varying(255),
+    groupe character varying(50) NOT NULL,
+    actif boolean NOT NULL
 );
 
 

diff --git a/data/update_1.4to1.5.sql b/data/update_1.4to1.5.sql
@@ -232,7 +232,140 @@ ALTER TABLE synthese.v_tree_taxons_synthese
   OWNER TO geonatuser;
 GRANT ALL ON TABLE synthese.v_tree_taxons_synthese TO geonatuser;
 
+--Généricité
 ALTER TABLE meta.bib_programmes RENAME sitpn TO programme_public;
 ALTER TABLE meta.bib_programmes RENAME desc_programme_sitpn TO desc_programme_public;
+--Gestion du contenu du "Comment ?" dans la synthèse
 ALTER TABLE meta.bib_programmes ADD COLUMN actif boolean;
-UPDATE meta.bib_programmes SET actif = true;
+UPDATE meta.bib_programmes SET actif = true;
+
+--gestion dynamique des liens d'accès aux formulaires sur la page d'accueil
+ALTER TABLE synthese.bib_sources ADD COLUMN url character varying(255);
+COMMENT ON COLUMN synthese.bib_sources.url IS 'Définir l''url d''accès au formulaire de saisie de cette source de données - optionnel';
+ALTER TABLE synthese.bib_sources ADD COLUMN target character varying(10);
+COMMENT ON COLUMN synthese.bib_sources.url IS 'Indiquer si le formulaire de saisie de cette source de données s''ouvre dans un nouvel onglet - optionnel';
+ALTER TABLE synthese.bib_sources ADD COLUMN picto character varying(255);
+COMMENT ON COLUMN synthese.bib_sources.url IS 'Définir le chemin du pictogramme identifiant le protocole en lien avec la source de données - optionnel';
+ALTER TABLE synthese.bib_sources ADD COLUMN groupe character varying(50);
+COMMENT ON COLUMN synthese.bib_sources.url IS 'Placer cette source de données dans un groupe (exemple FAUNE ou FLORE) - optionnel';
+ALTER TABLE synthese.bib_sources ADD COLUMN actif boolean;
+COMMENT ON COLUMN synthese.bib_sources.url IS 'Définir si le formulaire de saisie de cette source de données doit aparaitre ou non sur la page d''accueil - optionnel';
+--Attention si vous avez déjà une sources avec l'identifiant 2, vous devez adapter la ligne ci-dessous
+INSERT INTO synthese.bib_sources (id_source, nom_source, desc_source, host, port, username, pass, db_name, db_schema, db_table, db_field, url, target, picto, groupe, actif) VALUES (2, 'Mortalité', 'contenu des tables t_fiche_cf et t_releves_cf de la base faune postgres', 'localhost', 22, NULL, NULL, 'geonaturedb', 'contactfaune', 't_releves_cf', 'id_releve_cf', 'mortalite', NULL, 'images/pictos/squelette.png', 'FAUNE', true);
+UPDATE synthese.bib_sources SET actif = true;
+UPDATE synthese.bib_sources SET actif = false WHERE id_source = 4;
+UPDATE synthese.bib_sources SET groupe = 'FAUNE' WHERE id_source IN(1,2,3);
+UPDATE synthese.bib_sources SET groupe = 'FLORE' WHERE id_source IN(4,5,6);
+UPDATE synthese.bib_sources SET url = 'cf' WHERE id_source = 1;
+UPDATE synthese.bib_sources SET url = 'mortalite' WHERE id_source = 2;
+UPDATE synthese.bib_sources SET url = 'invertebre' WHERE id_source = 3;
+UPDATE synthese.bib_sources SET url = 'pda' WHERE id_source = 4;
+UPDATE synthese.bib_sources SET url = 'fs' WHERE id_source = 5;
+UPDATE synthese.bib_sources SET url = 'bryo' WHERE id_source = 6;
+UPDATE synthese.bib_sources SET picto = 'images/pictos/amphibien.gif' WHERE id_source = 1;
+UPDATE synthese.bib_sources SET picto = 'images/pictos/squelette.png' WHERE id_source = 2;
+UPDATE synthese.bib_sources SET picto = 'images/pictos/insecte.gif' WHERE id_source = 3;
+UPDATE synthese.bib_sources SET picto = 'images/pictos/plante.gif' WHERE id_source = 4;
+UPDATE synthese.bib_sources SET picto = 'images/pictos/plante.gif' WHERE id_source = 5;
+UPDATE synthese.bib_sources SET picto = 'images/pictos/mousse.gif' WHERE id_source = 6;
+
+--mise à jour du trigger contactfaune.synthese_insert_releve_cf
+CREATE OR REPLACE FUNCTION contactfaune.synthese_insert_releve_cf()
+  RETURNS trigger AS
+$BODY$
+DECLARE
+	fiche RECORD;
+	test integer;
+	mesobservateurs character varying(255);
+	criteresynthese integer;
+	idsource integer;
+	danslecoeur boolean;
+	unite integer;
+BEGIN
+	--Récupération des données dans la table t_fiches_cf et de la liste des observateurs
+	SELECT INTO fiche * FROM contactfaune.t_fiches_cf WHERE id_cf = new.id_cf;
+	SELECT INTO criteresynthese id_critere_synthese FROM contactfaune.bib_criteres_cf WHERE id_critere_cf = new.id_critere_cf;
+	-- Récupération du id_source selon le critère d'observation, Si critère = 2 alors on est dans une source mortalité (=2) sinon cf (=1)
+    IF criteresynthese = 2 THEN idsource = 2;
+	ELSE
+	    idsource = 1;
+	END IF;
+	SELECT INTO mesobservateurs o.observateurs FROM contactfaune.t_releves_cf r
+	JOIN contactfaune.t_fiches_cf f ON f.id_cf = r.id_cf
+	LEFT JOIN (
+                SELECT id_cf, array_to_string(array_agg(r.nom_role || ' ' || r.prenom_role), ', ') AS observateurs 
+                FROM contactfaune.cor_role_fiche_cf c
+                JOIN utilisateurs.t_roles r ON r.id_role = c.id_role
+                GROUP BY id_cf
+            ) o ON o.id_cf = f.id_cf
+	WHERE r.id_releve_cf = new.id_releve_cf;
+	-- on calcul si on est dans le coeur
+	IF st_intersects((SELECT the_geom FROM layers.l_zonesstatut WHERE id_zone = 3249), fiche.the_geom_27572) THEN 
+	    danslecoeur = true;
+	ELSE
+	    danslecoeur = false;
+	END IF;
+
+	INSERT INTO synthese.synthesefaune (
+		id_source,
+		id_fiche_source,
+		code_fiche_source,
+		id_organisme,
+		id_protocole,
+		codeprotocole,
+		ids_protocoles,
+		id_precision,
+		cd_nom,
+		id_taxon,
+		insee,
+		dateobs,
+		observateurs,
+		altitude_retenue,
+		remarques,
+		derniere_action,
+		supprime,
+		the_geom_27572,
+		the_geom_3857,
+		the_geom_2154,
+		the_geom_point,
+		id_lot,
+		id_critere_synthese,
+		effectif_total,
+		coeur
+	)
+	VALUES(
+	idsource,
+	new.id_releve_cf,
+	'f'||new.id_cf||'-r'||new.id_releve_cf,
+	fiche.id_organisme,
+	fiche.id_protocole,
+	1,
+	fiche.id_protocole,
+	1,
+	new.cd_ref_origine,
+	new.id_taxon,
+	fiche.insee,
+	fiche.dateobs,
+	mesobservateurs,
+	fiche.altitude_retenue,
+	new.commentaire,
+	'c',
+	false,
+	fiche.the_geom_27572,
+	fiche.the_geom_3857,
+	fiche.the_geom_2154,
+	fiche.the_geom_3857,
+	fiche.id_lot,
+	criteresynthese,
+	new.am+new.af+new.ai+new.na+new.jeune+new.yearling+new.sai,
+	danslecoeur
+	);
+
+	RETURN NEW; 			
+END;
+$BODY$
+  LANGUAGE plpgsql VOLATILE
+  COST 100;
+ALTER FUNCTION contactfaune.synthese_insert_releve_cf()
+  OWNER TO geonatuser;
+GRANT EXECUTE ON FUNCTION contactfaune.synthese_insert_releve_cf() TO geonatuser;
diff --git a/docs/changelog.rst b/docs/changelog.rst
@@ -10,19 +10,28 @@ TODO
  - rendre le schéma taxonomie totalement compatible avec taxhub
  - tests complémentaires et bug fix
 
+
 1.5.0.dev0
 ------------------
 
 **Note de version**
 
 * Pour les changements dans la base vous pouvez exécuter le fichier ``data/update_1.4to1.5.sql``
-
+* Si vous souhaitez désactiver certains programmes dans le "Comment ?" de la synthèse vous devez utiliser le champs ``actif`` de la table meta.bib_programmes
+* Compléter les champs ``url``, ``target``, ``picto``, ``groupe`` et ``actif`` dans la table ``synthese.bib_sources`
+* Ajouter le paramètre ``id_source_mortalite = 2;`` au fichier ``web/js/config.js``;
+* Ajouter le paramètre ``public static $id_source_mortalite = 2;`` au fichier ``lib/sfGeonatureConfig.php``;
+* si vous avez déjà des données de mortalité enregistrée, vous devez adapater la requête SQL ci-dessous avec votre id_source pour  mortalité et l'exécuter
+    ::
+        UPDATE synthese.syntheseff SET id_source = 2 WHERE id_source = 1 AND id_critere_synthese = 2;
 
 **Changements**
 
 * Optimisation des vues aux chargement des listes de taxons #64
 * Généricité des champs dans meta.bib_programmes (champs ``sitpn`` renommé en ``public``) #68
-* Ajout d'un champ ``actif`` permettant de masquer certains programme dans le "Comment ?" de la synthese #66
+* Ajout d'un champ ``actif`` à la table ``meta.bib_programmes`` permettant de masquer certains programmes dans le "Comment ?" de la synthèse #66
+* Construire dynamiquement la liste des liens vers la saisie des protocoles à partir de la table ``synthese.bib_sources`` #69
+
 
 1.4.0 (2015-10-16)
 ------------------

diff --git a/lib/model/doctrine/BibSourcesTable.class.php b/lib/model/doctrine/BibSourcesTable.class.php
@@ -8,4 +8,22 @@ public static function getInstance()
     {
         return Doctrine_Core::getTable('BibSources');
     }
+    public static function listSourcesGroupes()
+    {
+
+        $dbh = Doctrine_Manager::getInstance()->getCurrentConnection()->getDbh();
+        $sql = "(SELECT DISTINCT groupe FROM synthese.bib_sources WHERE actif = true)";
+        $query = $dbh->query($sql)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
+        return $query;
+    }
+    public static function listActiveSources()
+    {
+        $query= Doctrine_Query::create()
+            ->select('id_source, nom_source, url, target, picto, groupe, actif' )
+            ->from('BibSources')
+            ->where('actif = true')
+            ->orderBy('groupe')
+            ->fetchArray();
+        return $query;
+    }
 }