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Julia Version 1.5.0-DEV.232
Commit f014071421 (2020-02-03 21:36 UTC)
Platform Info:
OS: Linux (x86_64-linux-gnu)
CPU: Intel(R) Xeon(R) Silver 4114 CPU @ 2.20GHz
WORD_SIZE: 64
LIBM: libopenlibm
LLVM: libLLVM-9.0.1 (ORCJIT, skylake)
Environment:
JULIA_DEPOT_PATH = ::/usr/local/share/julia
JULIA_NUM_THREADS = 2
Resolving package versions...
Installed Glib_jll ──────────────────── v2.59.0+1
Installed Xorg_renderproto_jll ──────── v0.11.1+0
Installed GenomicMaps ───────────────── v0.1.2
Installed JpegTurbo_jll ─────────────── v2.0.1+0
Installed SortingAlgorithms ─────────── v0.3.1
Installed Xorg_libXau_jll ───────────── v1.0.9+0
Installed TableTraits ───────────────── v1.0.0
Installed OffsetArrays ──────────────── v1.0.2
Installed RecipesBase ───────────────── v0.7.0
Installed Expat_jll ─────────────────── v2.2.7+0
Installed HarfBuzz_jll ──────────────── v2.6.1+4
Installed FreeType2_jll ─────────────── v2.10.1+1
Installed Juno ──────────────────────── v0.7.2
Installed Libiconv_jll ──────────────── v1.16.0+1
Installed BufferedStreams ───────────── v1.0.0
Installed Libgpg_error_jll ──────────── v1.36.0+0
Installed Xorg_libxcb_jll ───────────── v1.13.0+0
Installed ColorVectorSpace ──────────── v0.8.3
Installed Bzip2_jll ─────────────────── v1.0.6+1
Installed Missings ──────────────────── v0.4.3
Installed Xorg_libXdmcp_jll ─────────── v1.1.3+0
Installed Xorg_libpthread_stubs_jll ─── v0.1.0+0
Installed YAML ──────────────────────── v0.3.2
Installed Requires ──────────────────── v1.0.1
Installed Media ─────────────────────── v0.5.0
Installed Colors ────────────────────── v0.11.2
Installed PCRE_jll ──────────────────── v8.42.0+1
Installed X11_jll ───────────────────── v1.6.8+5
Installed Cairo_jll ─────────────────── v1.16.0+2
Installed XSLT_jll ──────────────────── v1.1.33+0
Installed ColorTypes ────────────────── v0.9.1
Installed BioCore ───────────────────── v2.0.5
Installed SpecialFunctions ──────────── v0.10.0
Installed MacroTools ────────────────── v0.5.3
Installed Luxor ─────────────────────── v1.7.0
Installed Libffi_jll ────────────────── v3.2.1+0
Installed Reexport ──────────────────── v0.2.0
Installed Xorg_kbproto_jll ──────────── v1.0.7+0
Installed Xorg_inputproto_jll ───────── v2.3.2+0
Installed TranscodingStreams ────────── v0.9.5
Installed Libgcrypt_jll ─────────────── v1.8.5+0
Installed CategoricalArrays ─────────── v0.7.7
Installed ImageCore ─────────────────── v0.8.11
Installed BioSequences ──────────────── v1.1.0
Installed Libtiff_jll ───────────────── v4.0.10+0
Installed DataValueInterfaces ───────── v1.0.0
Installed PaddedViews ───────────────── v0.5.1
Installed ImageMagick ───────────────── v1.1.2
Installed LZO_jll ───────────────────── v2.10.0+0
Installed Codecs ────────────────────── v0.5.0
Installed IntervalTrees ─────────────── v1.0.0
Installed JSON ──────────────────────── v0.21.0
Installed InvertedIndices ───────────── v1.0.0
Installed Zlib_jll ──────────────────── v1.2.11+8
Installed Graphite2_jll ─────────────── v1.3.13+1
Installed XML2_jll ──────────────────── v2.9.9+1
Installed Combinatorics ─────────────── v0.7.0
Installed IndexableBitVectors ───────── v1.0.0
Installed BioSymbols ────────────────── v3.1.0
Installed Automa ────────────────────── v0.8.0
Installed StatsBase ─────────────────── v0.32.0
Installed GZip ──────────────────────── v0.5.1
Installed Xorg_util_macros_jll ──────── v1.19.2+0
Installed Xorg_xextproto_jll ────────── v7.3.0+0
Installed MappedArrays ──────────────── v0.2.2
Installed ImageMagick_jll ───────────── v6.9.10-12+0
Installed Zstd_jll ──────────────────── v1.4.4+0
Installed Fontconfig_jll ────────────── v2.13.1+10
Installed Xorg_xproto_jll ───────────── v7.0.31+0
Installed Xorg_xtrans_jll ───────────── v1.4.0+0
Installed FileIO ────────────────────── v1.2.1
Installed DataFrames ────────────────── v0.20.0
Installed Twiddle ───────────────────── v1.1.1
Installed Pixman_jll ────────────────── v0.38.4+1
Installed DataAPI ───────────────────── v1.1.0
Installed Pango_jll ─────────────────── v1.42.4+7
Installed DataStructures ────────────── v0.17.9
Installed OrderedCollections ────────── v1.1.0
Installed NaNMath ───────────────────── v0.3.3
Installed Parsers ───────────────────── v0.3.11
Installed OpenSpecFun_jll ───────────── v0.5.3+1
Installed FriBidi_jll ───────────────── v1.0.5+2
Installed Tables ────────────────────── v0.2.11
Installed PooledArrays ──────────────── v0.5.3
Installed Libuuid_jll ───────────────── v2.34.0+3
Installed Xorg_libXext_jll ──────────── v1.3.4+0
Installed Xorg_libXrender_jll ───────── v0.9.10+0
Installed Gettext_jll ───────────────── v0.20.1+1
Installed Xorg_xcb_proto_jll ────────── v1.13.0+0
Installed GenomicAnnotations ────────── v0.1.1
Installed Graphics ──────────────────── v1.0.1
Installed FixedPointNumbers ─────────── v0.7.1
Installed IteratorInterfaceExtensions ─ v1.0.0
Installed Xorg_libX11_jll ───────────── v1.6.8+0
Installed libpng_jll ────────────────── v1.6.37+2
Installed QuartzImageIO ─────────────── v0.7.0
Installed Compat ────────────────────── v2.2.0
Installed Polynomials ───────────────── v0.6.0
Installed Cairo ─────────────────────── v1.0.2
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Updating `~/.julia/environments/v1.5/Project.toml`
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Updating `~/.julia/environments/v1.5/Manifest.toml`
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[7e6ae17a] + BioSequences v1.1.0
[3c28c6f8] + BioSymbols v3.1.0
[e1450e63] + BufferedStreams v1.0.0
[6e34b625] + Bzip2_jll v1.0.6+1
[159f3aea] + Cairo v1.0.2
[83423d85] + Cairo_jll v1.16.0+2
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[3da002f7] + ColorTypes v0.9.1
[c3611d14] + ColorVectorSpace v0.8.3
[5ae59095] + Colors v0.11.2
[861a8166] + Combinatorics v0.7.0
[34da2185] + Compat v2.2.0
[9a962f9c] + DataAPI v1.1.0
[a93c6f00] + DataFrames v0.20.0
[864edb3b] + DataStructures v0.17.9
[e2d170a0] + DataValueInterfaces v1.0.0
[2e619515] + Expat_jll v2.2.7+0
[5789e2e9] + FileIO v1.2.1
[53c48c17] + FixedPointNumbers v0.7.1
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[d7e528f0] + FreeType2_jll v2.10.1+1
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[4f8a0a0a] + GenomicAnnotations v0.1.1
[db448a0f] + GenomicMaps v0.1.2
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[524e6230] + IntervalTrees v1.0.0
[41ab1584] + InvertedIndices v1.0.0
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[1914dd2f] + MacroTools v0.5.3
[dbb5928d] + MappedArrays v0.2.2
[e89f7d12] + Media v0.5.0
[e1d29d7a] + Missings v0.4.3
[77ba4419] + NaNMath v0.3.3
[6fe1bfb0] + OffsetArrays v1.0.2
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[2dfb63ee] + PooledArrays v0.5.3
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[3cdcf5f2] + RecipesBase v0.7.0
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[ea2f1a96] + Xorg_libXrender_jll v0.9.10+0
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[c7cfdc94] + Xorg_libxcb_jll v1.13.0+0
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[d13bc2ba] + Xorg_xextproto_jll v7.3.0+0
[46797783] + Xorg_xproto_jll v7.0.31+0
[c5fb5394] + Xorg_xtrans_jll v1.4.0+0
[ddb6d928] + YAML v0.3.2
[83775a58] + Zlib_jll v1.2.11+8
[3161d3a3] + Zstd_jll v1.4.4+0
[b53b4c65] + libpng_jll v1.6.37+2
[2a0f44e3] + Base64
[ade2ca70] + Dates
[8bb1440f] + DelimitedFiles
[8ba89e20] + Distributed
[9fa8497b] + Future
[b77e0a4c] + InteractiveUtils
[76f85450] + LibGit2
[8f399da3] + Libdl
[37e2e46d] + LinearAlgebra
[56ddb016] + Logging
[d6f4376e] + Markdown
[a63ad114] + Mmap
[44cfe95a] + Pkg
[de0858da] + Printf
[9abbd945] + Profile
[3fa0cd96] + REPL
[9a3f8284] + Random
[ea8e919c] + SHA
[9e88b42a] + Serialization
[1a1011a3] + SharedArrays
[6462fe0b] + Sockets
[2f01184e] + SparseArrays
[10745b16] + Statistics
[8dfed614] + Test
[cf7118a7] + UUIDs
[4ec0a83e] + Unicode
ERROR: Package GenomicMaps did not provide a `test/runtests.jl` file
Stacktrace:
[1] pkgerror(::String, ::Vararg{String,N} where N) at /workspace/srcdir/usr/share/julia/stdlib/v1.5/Pkg/src/Types.jl:53
[2] test(::Pkg.Types.Context, ::Array{Pkg.Types.PackageSpec,1}; coverage::Bool, julia_args::Cmd, test_args::Cmd, test_fn::Nothing) at /workspace/srcdir/usr/share/julia/stdlib/v1.5/Pkg/src/Operations.jl:1474
[3] test(::Pkg.Types.Context, ::Array{Pkg.Types.PackageSpec,1}; coverage::Bool, test_fn::Nothing, julia_args::Cmd, test_args::Cmd, kwargs::Base.Iterators.Pairs{Union{},Union{},Tuple{},NamedTuple{(),Tuple{}}}) at /workspace/srcdir/usr/share/julia/stdlib/v1.5/Pkg/src/API.jl:316
[4] test(::Pkg.Types.Context, ::Array{Pkg.Types.PackageSpec,1}) at /workspace/srcdir/usr/share/julia/stdlib/v1.5/Pkg/src/API.jl:303
[5] #test#68 at /workspace/srcdir/usr/share/julia/stdlib/v1.5/Pkg/src/API.jl:297 [inlined]
[6] test at /workspace/srcdir/usr/share/julia/stdlib/v1.5/Pkg/src/API.jl:297 [inlined]
[7] #test#67 at /workspace/srcdir/usr/share/julia/stdlib/v1.5/Pkg/src/API.jl:296 [inlined]
[8] test at /workspace/srcdir/usr/share/julia/stdlib/v1.5/Pkg/src/API.jl:296 [inlined]
[9] test(::String; kwargs::Base.Iterators.Pairs{Union{},Union{},Tuple{},NamedTuple{(),Tuple{}}}) at /workspace/srcdir/usr/share/julia/stdlib/v1.5/Pkg/src/API.jl:295
[10] test(::String) at /workspace/srcdir/usr/share/julia/stdlib/v1.5/Pkg/src/API.jl:295
[11] top-level scope at none:13